sed：小工具，大用处

在linux环境中，除了常用的ll、ls、less等查看命令外，sed和awk是处理文本的强大工具。它们能够以简单的方式完成复杂的文本编辑任务。接下来，我将详细介绍sed和awk的使用方法。

sed是一个非常实用的文本处理工具，通常以行为单位进行操作，可以对数据进行替换、删除、新增和选取等操作。sed既可以处理标准输入，也可以处理文件，并将结果输出到标准输出或文件中。以下是sed的一般使用规则：

sed -nefri '动作命令' 文件或输入

参数说明：

• -n：使用安静模式。通常，sed会将所有STDIN的资料输出到屏幕上，但加上-n后，只有经过sed特殊处理的行或动作才会被输出。
• -e：直接在命令行模式上进行sed的动作编辑。
• -f：将sed的动作命令写在一个文件中，使用-f filename可以执行该文件中的sed动作。
• -r：支持扩展正则表达式语法（默认使用基础正则表达式语法）。
• -i：直接修改读取的文件内容，而不是输出到屏幕。

动作命令：

• a：新增，在当前行之后添加新行内容。
• c：替换，用新内容替换指定范围内的行。
• d：删除，通常不接任何参数，直接删除指定行。
• g：全局，表示在行内全局执行动作，例如替换所有匹配的关键字。
• i：新增，在当前行之前添加新行内容。
• p：打印，通常与-n参数一起使用，输出选定的行。
• s：替换，用于直接进行替换操作，常与正则表达式搭配使用。

新增与删除功能

sed可以根据行号进行删除操作。例如，列出文件内容并删除第2-5行：

可以看到标准输出中少了第2-5行，最后一行可以用“$”表示。这里省略了-e参数，因为默认就是在命令行模式下操作。也可以根据关键字删除，例如删除包含“CHEN”的行：

但此时文件内容并未被更改，若要删除原文件内容并保存，可以使用-i参数：

注意，尽管前三行被删除，行号仍然从第一行开始，因为nl处理的是文件而不是标准输出。接下来，我们展示如何新增新行内容：

可以明显看出a和i两个新增命令的区别。可以通过“+回车”来添加多行内容：

替换与显示功能

sed的p命令可以根据行号显示内容，例如显示文件中的第5-7行：

c命令可以进行整行内容替换，例如将文件第2-4行的重复内容替换为“reduplicates”：

s命令可以查找关键字并进行替换，可以结合正则表达式使用。例如，将文件中所有的“：”替换为“；”：

其中，g表示全局替换，即每一行中的所有匹配都进行替换。如果不加g，则只替换找到的第一个关键字：

sed还可以直接处理文件，在处理多文库数据时，常需替换重复的barcode，如下所示：

上面的例子中，第一条命令将替换结果保存为新文件，而后两条命令则直接修改原文件。其中，“^”表示只替换行首出现的关键字。